La Agencia de Obra Pública de la Junta de Andalucía está adscrita a la Consejería de Fomento, Infraestructuras y Ordenación del Territorio para el desarrollo de infraestructuras del transporte, aunque su actividad incluye cualquier obra y equipamiento público. En la actualidad, la agencia gestiona la construcción y explotación directa del Metropolitano de Granada y del tren-tram de la Bahía de Cádiz, de las concesiones del Metro de Sevilla y Metro de Málaga. En carreteras gestiona la construcción de obras de gran capacidad y en la red interprovincial, así como actuaciones en entornos urbanos y en la red ciclista.

La Consejería fija los objetivos y directrices llevando a cabo el seguimiento y controlando la eficacia. De acuerdo a estos fines, la agencia desarrolla su actividad que le son atribuidas por el Consejo de Gobierno de la Junta de Andalucía, cuya gestión es encomendada por la Consejería de Fomento, Infraestructuras y Ordenación del Territorio, u otras Consejerías o Agencias.

La actividad de la Agencia estará orientada por los principios de eficacia y eficiencia, interés público, instrumentalidad, publicidad y concurrencia. La aprobación de los nuevos estatutos de la Agencia, mediante el Decreto 175/2018 de 18 de septiembre, y previa aprobación por Consejo de Gobierno de la Junta de Andalucía, redunda en el reforzamiento y materialización de los principios antes referidos, incorporando, entre otros elementos, la adscripción de personal funcionario de la Consejería al ente público para el ejercicio de potestades administrativas en los procedimientos que regulan sus actuaciones.